港澳通行證簽註可以異地辦理。異地辦理需要提供本人有效的身份證明,就業人員需提供一年及以上有效的居住證、社保證明,高等院校在讀的學生需提供加蓋學校公章的證明及學生證,就可以異地辦理簽註。
2018年9月1日起,內地居民可在全國範圍內任一公安出入境管理機構異地申請換(補)發普通護照、往來港澳通行證、往來臺灣通行證可在全國範圍內任一公安出入境管理機構異地申請往來港澳臺團隊旅遊簽註。
2019年4月1日起,中華人民共和國往來港澳通行證,實行“全國通辦”。申請人異地申辦赴港澳臺團隊旅遊簽註,還可在自助簽註機上辦理,立等可取。從2019年7月1日起,往來港澳通行證收費標準由80元/張降爲60元/張。