尼羅河流域大多地處熱帶荒漠帶,即熱帶沙漠氣候,由信風帶控制,所以全年高温少雨。
尼羅河很小一部分是地處亞熱帶常綠硬葉林帶,即地中海氣候,由信風帶和西風帶交替控制,所以夏季高温少雨,冬季温和濕潤。綜合來説,氣候特徵為高温少雨。