防城港市現有防城港、企沙港、京島港、竹山港等大小商港、漁港20多個。其中防城港以水深、避風、不淤積、航道短、可用岸線長而著名。2006年8月16日國務院常務會議通過的《全國沿海港口布局規劃》,明確防城港是全國沿海24個主要港口之一,13個接卸進口鐵礦石港口之一和19個集裝箱支線港之一。此外,全市岸線資源豐富,企沙海域具備建設10-30萬噸級泊位的天然條件。