紙層析是以濾紙為惰性支持物的分配層析。
優點:濾紙纖維和水有較強的親和力，能吸收22%左右的水，而且其中6~7%的水是以氫鍵形式與纖維素的羥基結合，在一般條件下較難脱去，而濾紙纖維與有機溶劑的親和力甚弱，所以一般的紙層析實際上是以濾紙纖維的結合水為固定相，以有機溶劑為流動相。提取有關光合作用色素的實驗中，就是利用紙層析法，將溶解度不同的色素提取出來
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