三氯異氰尿酸消毒粉通常用於糞池以及路面的消毒工作。通常將三氯異氰尿酸消毒粉灑在所需消毒的路面上，並進行噴水，從而達到消毒的效果。
在對養殖場的糞池進行消毒時，三氯異氰尿酸消毒粉的用量通常為糞池總量的1/5，同時在漂白的過程中，還應進行不斷攪拌，以提高消毒效果。
但由於三氯異氰尿酸消毒粉會對金屬物質造成腐蝕，因此在撒三氯異氰尿酸消毒粉時應儘量避開金屬物質
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