所謂無菌包裝是將殺菌後的牛乳,在無菌條件下裝入事先殺過菌的容器內。可供牛乳製品無菌包裝的設備主要有:無菌菱形袋包裝機、無菌磚形盒包裝機、多爾無菌灌裝系統、安德遜成型密封機等。
牛奶從無菌冷卻器流入包裝線,包裝線是在無菌條件下操作的。為了補償設備能力的差額或者包裝機停頓時的不平衡狀態,可在殺菌器和包裝線之間安裝一個無菌罐。這樣,如果包裝線停了下來,產品便可貯存在無菌罐中。當然處理的奶也可以直接從殺菌器輸送到無菌包裝機,由於包裝處理不了而出現的多餘奶可通過安全閥迴流到殺菌設備,這一設計可減少無菌罐的潛在污染。