區別一、釋義不同
理性:1、指屬於判斷、推理等活動的。2、從理智上控制行為的能力。
通透:1、清澈透明。2、通徹透闢。3、通風透氣。
區別二、引證出處不同
理性:茅盾 《宿莽·色盲》:“她是靜默的,她是理性的,她是屬於舊時代的藴藏深情而不肯輕易流露的那一類人物。” 
通透:元·尚仲賢 《單鞭奪槊》第二折:“我精神抖擻,機謀通透。”
所謂“通透”,就是把事情看得很清晰透徹,在此基礎上的反向對人簡單直爽,這樣會減少對方的溝通成本,同時也會讓自己的人際交往不那麼複雜。
理性是指人在正常思維狀態下時為了獲得預期結果,有自信與勇氣冷靜地面對現狀,並快速全面瞭解現實分析出多種可行性方案,再判斷出最佳方案且對其有效執行的能力。
理性是基於現有的理論,通過合理的邏輯推導得到確定的結果。反之就是反理性。理性的本質就是否定與懷疑。