一般來説,幼魚教難區分,1齡魚區別較明顯,到了繁殖期特徵更明顯。
首先是觀察體形,雌魚體形短圓,雄魚較瘦長。
如果飼養的是高頭、虎頭、獅頭等品種,可觀察其頭部,雌魚的肉瘤較低欠豐滿
雄魚則高而飽滿。其次是觀察鰓蓋,到了繁殖期,雄魚鰓蓋有稀散的突起點狀追星。
雌魚的胸鰭短而端圓,雄魚胸鰭較長,尾端尖,繁殖期胸鰭上也有追星。
雌魚的泄殖孔圓而稍大,呈梨形,柄端向前,近胸鰭,微向外凸
雄魚稜形稍小,如棗核,兩端較尖,中間膨大,平而稍凹。
還有就是繁殖期的雌魚遊動較慢,反應亦較遲鈍雄魚遊動活潑,追逐靈敏。
分辨錦鯉的公母:1、待錦鯉魚長到30或30cm以上時,看錦鯉魚的生殖孔,生殖孔是往外突出並有點寬的是雌錦鯉魚,反之往裏凹陷的是雄錦鯉魚。2、同齡的錦鯉魚中,雌錦鯉魚身體雖然短小一些但更顯豐滿,雄錦鯉魚則是比較細長。3、頭部:雌錦鯉魚的頭部稍窒息窄而且比較長,雄錦鯉魚頭部的額部稍有突起。4、腹部:雌錦鯉魚的腹部豐滿,而雄錦鯉魚的腹部比較寬平。
5、胸鰭:雌錦鯉魚的胸鰭呈現橢圓形而雄錦鯉魚的胸鰭則比較尖。