青年醫生的結局：
第50集
程俊又在病房守了歐陽一夜。第二天清晨，歐陽告訴程俊自己跟沈青川估計沒戲了。歐陽説經過反思，發現自己似乎並不適合結婚，還沒有很好地懂得什麼叫愛，應該怎麼愛。
兩人談着，沈青川恰好在門外要來看歐陽，聽到這些話的沈青川神色黯淡，轉身離開了。程俊跟趙衝談話，問他去社區醫院怎麼都沒跟自己商量，玩起了先斬後奏。
趙衝説自己想去社區醫院多做一些科普、諮詢的工作，多向百姓傳播一些理念，比如死亡教育等等，讓人們在得病以後不再那麼驚慌，能正確的看待疾病。
而且自己要重新構思小説，社區醫院更接地氣，更能瞭解到患者的日常生活。程俊理解趙衝的心態，讓他無論在哪裏都好好幹，做個好醫生，趙衝笑着答應。
曾主任叫程俊上天台，他對於自己沒能爭取下名額留住趙沖和鄒倚夢仍舊很難過，程俊勸曾主任，年輕人總有自己的路要走。曾主任得知歐陽要和沈青川分手的消息，讓程俊把握住機會，追回歐陽。
又到了歐陽的生日，急診科的同事給歐陽準備了生日會。此時沈青川已經辭職，但他送來一個蛋糕，上面寫着“祝你幸福”。歐陽許願説，去年程俊送了自己一個生日蛋糕，今年沒有送，那明年再送一個吧。
程俊一愣，大家都歡呼起來。急診科的青年醫生們來到裘院長的慈善醫院，醫院裏收治了十幾個邊疆的先心病兒童，裘院長在社會上籌集資金，馬上就要給這些孩子做手術了。
慈善醫院裏，歐陽意外見到了沈青川，他辭職後來到了這裏，給裘院長幫忙。沈青川希望在這裏重新認識自己，讓自己重新幸福起來。沈青川告訴歐陽，其實最適合她的人是程俊，他希望歐陽不要再錯過，祝他們幸福。
歐陽、程俊、王博、鄒倚夢、艾小天、趙衝齊聚一堂，慶祝到來的畢業季。歐陽、程俊、王博祝三個實習生都成為一個好醫生，大家舉杯歡慶。
三個實習生走了，急診室裏好像空蕩了許多，歐陽、程俊、王博還有點不適應。沈青川在慈善醫院，給先心病的孩子講故事。林思和程明義結為了夫妻，兩個人勸歐陽和程俊也抓緊。
鄒倚夢下班，王博到私立醫院門口去接她，兩人開心的去吃晚飯。艾小天來到社區醫院，告訴趙衝，自己決定做他的女朋友，要求趙衝只許接受，不能拒絕，趙衝表面痛苦，實則開心的答應。
又有病人來了，歐陽、程俊、王博三人跑向急診大門，開始新一輪的戰鬥。
結局：程俊與急診室，克服困難，在醫治病患的過程中，不斷地挖掘自我，錘鍊醫德，在職業之路上堅持探索和守護，找到了急診室守護生命的意義。
《青年醫生》講述了青年醫生的夢想與成長，他們竭盡全力除人類之病痛，助健康之完美，維護醫術的聖潔和榮譽。
《青年醫生》大結局沈青川和歐陽領結婚證無果，歐陽去塌方的隧道進行救援時，發生意外。在得知歐陽受傷後沈青川痛斥讓一個女醫生出現場。曾主任和程俊向其道歉。隨後程俊守着歐陽醒過來，醒來後的歐陽向程俊説了自己的想法，認為自己還不適合結婚，覺得自己和沈青川沒戲了。而這一切又被門外的沈青川碰巧聽到了，黯然離開。
而三位實習生也都離開了急診，曾主任沒有爭取到趙沖和鄒倚夢留在急診的名額，鄒倚夢也有了自己的打算，決定跟着胡藝青去私立醫院工作，而趙衝則選擇了社區醫院，希望可以幫助到更多的人。
又到了歐陽的生日，沈青川卻已經辭職離開，送給了歐陽一個蛋糕上面寫着祝你幸福。歐陽對着蛋糕許願，去年程俊送了一個蛋糕，今年卻沒有送，希望他明年再送一個。從這裏算是委婉的接受了程俊的愛意。而程俊的愛情長跑也終於結束了。而王博和鄒倚夢，艾小天和趙衝也修成了正果。青年醫生的愛情故事算是圓滿結束。
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