石菖蒲根部呈扁圓柱形,長約3-20釐米,直徑約0.3-1釐米,表面的顏色較深,呈灰棕色或者棕褐色。石菖蒲的葉片顏色為暗綠色,長度為20到50釐米,從底部對摺,葉脈平行分佈,稍稍有些隆起。
石菖蒲花朵形狀為三稜狀,顏色為黃綠色或者黃白色,花期大約在2月份左右。