關於巴氏的姓氏來源説法為下：
以水為姓。相傳，上古時伏羲氏有個後裔叫後照，定居於巴水，即今四川東部一帶。他的子孫就以巴水為姓，稱巴氏。若干代以後，住在這一帶（含今川、鄂、湘、黔邊地區）的共有五個民族：巴氏、樊氏、醰氏、相（向）氏、鄭氏。巴氏住在紅色的山洞裏，其他五族住在黑色的山洞裏。由於各自信仰的神靈不同，他們常常互相爭鬥，生活很不穩定。後來大家覺得這樣下去不行，就協商決定推舉一位共同的首領。方法是五族各派出一位代表進行比賽，贏的人就是首領。巴族推出的代表叫務相。他在兩場比賽（擲劍和賽船）中都取得了勝利，所以他就當上了五族的首領，號稱廩君，他的後代多數也稱巴氏。
國為姓。周代有巴子國，開始被封的國君是子爵。巴子國轄境相當於現在四川的旺巷周慎靚王五年（公元前316年），並於秦。巴子國國君的後代，就用原來的國名"巴"作為自己的姓氏，稱巴氏。《世本》雲："巴子國，子孫以國為氏。"
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