顯性基因和隱性基因的概念不同，性質不同，產生的物質不同以及書寫方式不同。
1、概念：顯性基因是一種能獨立決定後代特定遺傳性狀的，能量較強的等位基因，而隱性基因不能獨立決定後代的特性。
2、性質：無論是純合還是雜合的基因型，顯性基因都可以表現出來，但是隱性基因只有在純合時才可以表現出來。
3、產生的物質：隱性的等位基因往往是野生型發生了突變，因此不能產生有功能的酶等物質，而顯性的等位基因則可以產生有功能的物質，因此雜合子也可以表現出這類功能。
4、書寫方式：顯性基因用大寫字母表示，隱性基因用小寫字母表示。如（Xx）：X表示顯性等位基因，x表示隱性等位基因。
顯性基因就是非常明顯，一看就明白的基因：比如，一個孩子父親是雙眼皮，大眼睛，他也遺傳了父親的雙眼皮大眼睛，這就是顯性基因。
隱性基因就是用眼睛看不出來，但真真實實又存在的基因。比如一個人的性格遺傳
顯性基因和隱性基因是相對於一對具有相對性狀基因而言的概念，在一對雜合的等位基因中，能使其表現出性狀的基因或指對該性狀有決定性作用的基因。一對等位基因之間可能存在顯隱關係，如果等位基因中一個基因的作用可以抑制另一個基因的作用，我們就稱前一個基因對後一個基因為顯性，相反，後一個基因對前一個基因為隱性。
隱性基因是指這樣的一種等位基因，只有該基因是純合時，其決定的性狀才會表達出來。在雜合的狀態下， 生物體的表型顯示顯性基因決定的特徵。一般隱性基因用小寫字母表示，如果該基因顯性純合子表示為AA，則隱性純合子表示為aa，雜合子表示為Aa。
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