基因組,一般的定義是單倍體細胞中的全套染色體為一個基因組,或是單倍體細胞中的全部基因為一個基因組。可是基因組測序的結果發現基因編碼序列只佔整個基因組序列的很小一部分。因此,基因組應該指單倍體細胞中包括編碼序列和非編碼序列在內的全部DNA分子。説的更確切些,核基因組是單倍體細胞核內的全部 DNA分子線粒體基因組則是一個線粒體所包含的全部DNA分子葉綠體基因組則是一個葉綠體所包含的全部DNA分子。