團員檔案主要包括《中國共產主義青年團入團志願書》、入團申請書、入團積極分子培養考察(團校學習結業)材料、團員證、團員登記表、團內獎懲材料等。
團員檔案按照檔案管理規定,由相關組織或單位統一管理,不一定要和組織關係去向完全一致。對於檔案存放在人才市場的畢業學生團員,其組織關係按實際去向轉接至工作單位、經常居住地或户籍所在地團組織。