1、科屬區別:玻璃魚是鱵科鱵屬的,耗兒魚則屬於竹刀魚科秋刀魚屬。
2、肌肉顏色區別:玻璃魚的肌肉是透明的,耗兒魚不具有這個特徵。
3、分佈區別:玻璃魚生活在緯度高的地方,耗兒魚生活在緯度低的熱帶和温帶。