應該有區別,但區別不是很大。在編事業職工和合同制事業職工,基本上工資待遇一樣,因為合同制職工的工資標準或其它待遇是參考事業指標職工的標準而制定的。所以基本差不多,差別不大。但在編職工工資一般是上級財政部門劃撥的。
合同制職工是單位其他收入發的,還是有一點小差別,合同制工職工三年都要重新簽訂合同而在編職工不用三年,兩年籤合同。
合同制事業編制職工退休後,一般按上班交的社保發放退休金。在編職工是按事業具體規定發放退休金的。退休後,計算方式和方法是有一定的區別的。