主要區別有二:第一技術崗位有所不同。副教授是高等學校教師專業技術職稱,主要工作任務是教學,必須給大學生(或者黨校學員)研究生上課,研究員主要工作任務是在對應的專業領域開展科學研究。
第二,專業技術職級高低有所不同,副教授是副高級職稱,對應技術職稱崗位5、6、7三檔,研究員是正高級職稱,對應技術職稱崗位1、2、3、4四檔。