印度洋的生物資源主要有各種魚類、軟體動物和海獸。印度洋中年捕魚量約有500萬噸,比太平洋、大西洋少得多。印度洋中以印度半島沿海捕魚量最大,主要捕撈魚類有:鯖魚、沙丁魚和比目魚,非洲南岸還有金槍魚、飛魚及海龜等。
在近南極大陸的海域裏,還有鯉鯨、青鯨和豐瓦洛鯨。此外,在波斯灣的巴林羣島、阿拉伯海、斯里蘭卡和澳大利亞沿海還盛產珍珠。