甲型流感病毒的M2是由病毒RNA片段7剪切的mRNA編碼的97個氨基酸殘基組成的Ⅲ型膜內在蛋白(type Ⅲ integral membrane proteins),它被證明是由低pH激活的質子(H)選擇性的離子通道(proton-selective channel),是人們研究最深入的病毒離子通道。
流感病毒M2蛋白通過氫離子通道活性阻斷細胞自噬體與溶酶體的融合,從而抑制細胞自噬降解的重要機理。