不是，专项扣除是扣完5000元起征额才扣的，抵扣的是收入，而不是个人所得税。(注意是抵扣收入，而不是抵扣个人所得税)
例如，①业务发生在2018年10月：
小张应领工资9000元，社会保险支出1300元，不考虑其他因素，当月应缴的个人所得税如下：
应该交税的工资额=应领工资(9000)-社保(1300)-起征点(5000)=2700元。套用下表的第1级税率。
应该交的个税=2700*税率3%-速算扣除数0=81元
②业务发生在2019年1月：
小张应领工资9000元，社会保险支出1300元。专项附加扣除信息如下：小张本人是独生子女，父母均超过60周岁有两个孩子上小学还有使用首套贷款购买的房子正在读成人函授本科。
小张这个月专项附加扣除的金额分别如下：
1、独生子女赡养老人每月可以扣除2000元
2、两个孩子上小学，一个孩子可以扣除1000元，两个孩子可以扣除2000元
3、使用首套贷款购买的房子，可以扣除1000元。
4、读成人函授本科，每个月可以扣除400元。
小张以上四项的专项附加扣除，可以扣除5400元。
小张的应领工资9000元，扣除社保支出1300元，扣除起征点5000元，再减专项附加扣除5400元，小张应该交税的工资为负数，完全不用交税。
通过以上举例说明，实行专项附加扣除后，小张月应领工资9000元不用交税。通常情况下，六项专项附加扣除每个项目职工不一定都能享受到，但一般情形下，职工年应领工资十万元基本上不用交税。
注：如果职工的月平均应领工资在6000元以下，扣除社保和起征点后不够交税标准，可以不进行专项附加扣除信息的填报。
综上所述，专项扣除是扣完5000元起征额才扣的。
在社保扣除后。
个税专项扣除一般是五险一金，除此外，还有6个专项附加扣除（有的也说成专项扣除）。就是在扣除五险一金个人缴费部分后，在扣除专项附加扣除的金额。
专项附加扣除为子女教育，大病医疗，赡养老人，继续教育，租房补贴，住屋贷款。
其中子女教育为孩子年满3岁开始读书开始，一个子女每月可扣除1000元。
赡养老人一定是个人自己的父母，配偶的父母是不行的。需要父母年满60岁才行，一个父母每月可扣除1000元。
继续教育为学历教育，最多可扣除48个月，每月400元。如果是考取的职业证书，取得证书当年可一次性扣除3600元。
租房补贴和住屋贷款只能2选一，住屋贷款为1000元一月，租房补贴是根据公司所处的地方来扣除相应金额。
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