羊肚菌在曬乾的情況下可保存兩年之久。這種保存方法是經過處理的,首先要選擇無蟲孔、個體飽滿且無損傷的羊肚菌,再將其放入鹽水中浸泡,浸泡上四十分鐘左右即可。撈出用清水沖洗、除根,然後放在室外陽光充足處進行晾曬。晾曬時需時常翻動,均勻晾曬。此保存方法適合大部分的菌類,這樣處理後的羊肚菌可以保存兩年左右。
羊肚菌的保質期是多長時間要根據保存方法來判斷。如果放進保鮮袋裏,貯藏在冰箱冷藏層,大約可以保存5~7天。若放進保鮮袋後貯藏在冰箱冷凍層,那麼則可以保存1年。注意放進冰箱冷凍室,其温度要保持在-18度左右。