高錳酸鉀和紫外線可以殺死硝化細菌。鹽對細菌有抑制作用，但細菌適應緩慢，注意保持鹽濃度穩定。如果是輕微的高錳酸鉀，在沒有氫離子的情況下對硝化細菌沒有影響。建議不要用高錳酸鉀培養硝化細菌，即使高錳酸鉀完全氧化，仍會產生Mn+2。也是重金屬離子能使蛋白質變性，不利於硝化細菌的生長
高錳酸鉀能殺死硝化細菌，如果魚缸用高錳酸鉀浸泡消毒，若沒有沖洗太乾淨，有殘留，那麼想建立起硝化細菌，就有些困難，需要的時間會更長
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