主要是寒温帶大陸性季風氣候,因此,常年氣温較低,比較冷。漠河市是中國氣温最低的縣份,由於大陸及海洋季風交替影響,小氣候變化多端,局部氣候差異顯著。
冬季在極地大陸氣團控制下,氣候寒冷、乾燥而漫長漠河鎮地處北緯53°的中俄界江黑龍江南岸,常年寒冷如冬,夏季只有半個月左右,最高温度也不過20℃,夜裏只有10℃左右,而且晝長夜短,白晝可達19小時以上。漠河市年平均氣温在-5.5℃。各月平均氣温在0℃以下的月份長達8個月之久。氣温年較差為49.3℃。平均無霜期為86.2天。年平均降水量為460.8毫米,全年降水量70%以上集中在7月份。5-6月份為旱季,7-8月份為汛期。