珠海海關和深圳海關都是海關總署屬下的直屬海關,他們都有效地履行了國家賦予的把關服務職責。兩地海關的區別是各自管轄的關區範圍不同,珠海海關主要管轄的關區是珠海經濟特區和中山市,深圳海關主要管轄的關區是深圳經濟特區和惠州市。