1、針對對象不同。小餐飲證是各地針對三即食品小作坊、小經營店和小攤點食品經營許可證針對所有食品行業領域生產經營活動
2、適用【法律法規】不同。小餐飲證只適用各地方制定法規，食品經營許可證適用餐飲服務許可管理辦法，為國家【法律法規】
3、扮演身份不同。小作坊、小經營店和小攤點基本上無固定法定地點，多數為無工商營業執照，小餐飲證扮演臨時身份證角色食品經營許可證只是行業經營許可憑證
4、性質不同 。食品經營許可證的號碼一般是主要取統一社會信用代碼第三至第十七位而形成的。這二者的區別主要在於它們的性質不同，納税人識別號主要用在納税的時候，而餐飲服務許可證指的是該企業的標誌
5、應用部門不同。食品經營許可證是工商營業執照代碼，餐飲服務許可證是去税務局辦業務時提供的證件。
1、性質不同
食品經營許可證的號碼一般是主要取統一社會信用代碼第三至第十七位而形成的。這二者的區別主要在於它們的性質不同，納税人識別號主要用在納税的時候，而餐飲服務許可證指的是該企業的標誌。
2、應用部門不同
食品經營許可證是工商營業執照代碼，餐飲服務許可證是去税務局辦業務時提供的證件。
3、編碼不同
食品經營許可證號碼用18位的阿拉伯數字或大寫英文字母表示，由登記管理部門代碼（1位）、機構類別代碼（1位）、登記管理機關行政區劃碼（6位）、主體標識碼（組織機構代碼）（9位）和校驗碼（1位）5個部分組成，並對涉及到的組織機構、法人、其他組織、組織機構代碼、統一社會信用代碼等相關概念作出了規定。
而餐飲服務許可證一律由15位、17位、18或者20位碼（字符型）組成，其中：企業、事業單位等組織機構納税人，以國家質量監督檢驗檢疫總局編制的9位碼（其中區分主碼位與校驗位之間的“－”符省略不打印）並在其前面加掛6位行政區劃碼共15位碼。
4、登記證件不同
食品經營許可證通常簡稱為“税號”。餐飲服務許可證就是税務登記證上的號，每個企業的識別號都是唯一的。
而餐飲服務許可證登記在工商營業執照上。
5、開發票時填寫的信息不同
購買單位需要在餐飲服務許可證的“購買方納税人識別號”欄填寫購買方的統一社會信用代碼。購買方為企業的，索取增值税普通發票時，應向銷售方提供統一社會信用代碼。
而銷售方為其開具增值税普通發票時，應在“購買方納税人識別號”欄填寫購買方的納税人識別號，不符合規定的發票，不得作為税收憑證。
食品經營許可證是具有唯一性的，只要税務發票系統裏面查到了這家企業的納税人識別號，就可以查詢到這家企業的進銷項發票情況，也就可以知道企業是否虛開發票了。
小餐飲證指的是小型的餐飲許可證，也就是説可以經營小型的餐飲店的證件。小餐飲證僅僅只能經營小型的餐飲行業，而不能經營大型的餐飲行業。
食品經營許可證指的是獲得了食品銷售許可的證件，也就是説可以銷售該類食品的證件。食品經營許可證意味着可以售賣相關的食品。
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