亞甲基藍的用法是將其兑成溶液後，倒入魚缸中，一般100公升的水倒入5毫升藥物就可以了。這種藥可以預防水黴病、爛鰓病、白嘴、炸鱗等症狀，使用前一定要控制好用量，如果用量太多的話，很容易造成魚兒不適，甚至可能會產生藥害，不但起不到治療作用，還會危害其健康。
1）藥浴法
每升水加入10毫克亞甲基藍晶體，浸泡10--20分鐘，防治海淡水魚的水黴病，藥浴後撈回原缸。
（2）全缸潑灑在魚缸或者魚池中使藥物濃度達到2~3毫克/升，隔天使用一次，連用2~3次，可以預防和治療海淡水魚的水黴病
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