選品種優良、生長良好的植株留種於8~9月果熟期,當漿果呈黃綠色時採集,放陰涼處數日,再浸於水中,揉搓出種子,漂洗去果肉果皮等雜物,取出乾淨種子陰乾,並作濕沙藏或及時播種,魔芋的種子壽命較短,種子在室温下貯藏半年,其發芽率下降至10%左右,魔芋果實種子的結實率很低。
果實中的種子很少,用種子繁殖,收穫年限也較長,所以一般不採用種子繁殖,主要靠營養繁殖即塊莖繁殖。