順序為：魔法科高校的劣等生入學篇、 魔法科高校的劣等生九校戰篇、魔法科高校的劣等生暑假篇、魔法科高校的劣等生橫濱騷亂篇、魔法科高校的劣等生追憶篇、魔法科高校的劣等生來訪者篇、魔法科高校的劣等生雙七篇。
故事發生在二十一世紀末的日本。魔法已經不是一個傳説，而是現代科學的一項技術，它被應用至今已經過了一個世紀。曾經被稱為“超能力”的先天具有的能力被以“魔法”這兩個字為體系的名字取代
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