(1)藥物懸掛法
將藥物裝在有微孔的容器中，懸掛於食場周圍，緩慢溶解在水中，達到消毒的目的。可用於食場消毒的懸掛藥物主要有漂白粉、硫酸銅、敵百蟲等。懸掛的容器有竹簍、布袋、塑料袋、泡i塑料塊等。塑料袋裝藥後，用針在周圍扎小孔，孔的大小和數目可靈活掌握，以藥物維持在5小時以上溶解完，懸掛的周圍達到定濃度為依據。
泡沫塑料塊法即將藥物溶解後，以泡i塑料吸附後掛入食場。或將兩塊洹i塑料的面中央剪成凹坑後，在凹坑中置藥物，再用繩子將兩塑料塊捆紮在一起掛入食場。懸掛通常在餵食時應用，懸掛的數量以不妨礙魚羣進入食場為度。藥物懸掛法也可應用於流水養魚和水族箱養殖觀賞魚的消毒。
(2)灑藥法
每隔1~2個星期，在魚吃食後，用漂白粉消毒食場1次，用量般為250克，將溶化的漂白粉潑灑在食場周圍。
經一段間養殖後，水族箱和養殖魚池水體中的有機物及懸浮物質增加，水質逐漸惡化，並且魚病病原體也逐漸增加。因此，在魚病流行李節，應定期進行水體消毒，以殺滅水體中或魚體上的病原體。
水體消毒即在養殖水體中遍灑藥物。池塘中最常用的藥物是生石灰，生石灰不僅具有一定的殺菌作用，而且有良好的改善水質的功效。因此也常作為內部器官疾病治療前消毒水體的輔助用藥。每畝深1米的水面，用量為20~25千克。優良的水體消毒劑，殺菌的還有漂白粉(1毫克升)，漂粉精(.1~0.2毫克升)，二氯異氰尿酸鈉，三氯異氰尿酸(又名魚安、強氯精，0.3毫克升)，氧胺T(又名氧亞明，2毫克升)殺蟲藥有硫酸銅、硫酸亞鐵合劑(5:2，0.7毫克升)，90%晶體敵百蟲(2毫克升)，滅蟲靈(05毫克升)等，這些藥物都可用於水族箱的消毒。
食場消毒
要經常打撈食場的殘渣剩餌，並每隔5天用100~150克漂白粉或2.5~5公斤生石灰加水溶化後，均勻潑灑於食場水面（未溶於水的漂白粉或生石灰顆粒都不要投入，以免草、鯉魚當作餌料攝食後致死）。二是長期用藥物掛袋（簍），每袋中裝漂白粉100～150克或生石灰1.5~2.5公斤，20天左右換藥1次，每天每個食場掛袋（簍）2～3個。
池水消毒
每間隔半月左右，按每畝水面水深1米，用生石灰20～25公斤或漂白粉0.6公斤溶水全池潑灑。池水長期浸泡苦楝樹枝葉或樟樹枝葉，也可預防草魚出血、爛鰓、腸炎病的發生，每畝水面浸泡25～40公斤。
草料消毒
飼餵魚草料時，除要求鮮嫩、乾淨外，最好在飼餵前用2%的食鹽水或在1立方米水中放5~10克漂白粉溶液浸泡10～20分鐘後，再投料讓魚攝食。
內服消毒
飼餵魚精料時，除無黴無毒外，還可製藥餌讓魚服食。方法是每100公斤草魚，每10天用生大蒜1公斤加食鹽0.5公斤，搗爛後加入10～20公斤精飼料喂服，或用磺胺胍粉10～20克與0.5公斤飼料拌勻後飼餵。以上兩法都可有效地預防草魚腸炎病的發生。
糞肥消毒
糞肥施用前，先在糞池中堆漚發酵半月以上，再在每1000公斤糞肥中，加0.5公斤漂白粉消毒後使用。
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