東帝汶大部地區屬熱帶雨林氣候,平原、谷地屬熱帶草原氣候,年平均氣温26℃,年平均濕度為70%-80%。年平均降水量1200-1500毫米,但地區差異較大:北部沿海地區每年5月至11月為旱季,12月至翌年5月為雨季,年降水量為500-1500毫米南部沿海地區6月至12月為旱季,12月至翌年2月及5至6月為雨季,年降水量為1500-2000毫米中部山區年降水量為2500-3000毫米。