在夏、秋季掛果期間，不宜進行重修剪，否則會引起落果。由於在夏秋之交，氣温仍較高，陽光強烈，因而新梢可在長達40釐米後才摘心。同時，要在樹冠外圍保留部分未掛果的枝條，以避免果實發生日灼，降低商品價值。
番石榴樹一般在春季果實採收完畢後或果樹休眠將甦醒時進行。春季修剪首先，疏去過密、交叉、有病蟲和過於下垂的枝條。其次，對直徑2釐米以上的粗枝進行重剪，控制樹冠高度在1.8米以下。
因為若修剪不當會造成樹冠形成慢，落果，果實日灼，品質下降和經濟壽命縮短等。
番石榴為混合芽，既抽生新梢，又在其上開花結果，故只要新梢抽發，就有可能成為結果枝。
結果枝除着生於上一次老熟的枝梢外，也着生於一年生枝，且在這些枝條抽發的新梢結果性能最好，同時，番石榴在生長期都可以抽生新梢，只要有新梢抽生就能在其上開花結果，因此要對這些結果母枝進行培養。
因此，修剪樹番石榴的開花結果有十分重要的作用。
番石榴幼樹修剪
番石榴幼齡樹主權以整形為主，培養分枝分佈均勻、分枝角度適當、負荷力強的樹冠骨架，儘量保存有效枝梢，再在主枝、副主枝上培養結果枝，形成樹形矮化、有效枝梢多的樹冠。
番石榴幼齡樹的整形，從幼苗主幹離地40~50cm處剪斷定幹，促發新梢，培養為一級主枝，使樹體形成自然開心形。
當一級主枝長至40~cm再次摘心，促發分枝，各選留2~3條作副主枝，培養為二級主枝。種植前兩年要注意摘頂，目的是矮化及迅擴大樹冠，培養成矮化高產樹形，待結果後才疏剪過密枝、弱枝。
番石榴結果樹的修剪要針對不現樹勢，不同的時期，採用不同的修剪方法，促使樹勢中庸，以提高產量和果實的品質。
番石榴一般1年可多次結果，但產量較大的有二批，第一批在5月初開花，第二批在8月下旬至9月初開花，因此這兩批新梢要放好，同時做好果實膨大期的摘梢工作。
初結果的番石榴樹主要以控制旺長，增加有效枝梢的數量，促進抽發健壯結果枝為主，修剪宜輕。未結果的枝梢長至30cm時進行摘心，促使成為粗短的結果母枝，當年或第二年萌發結果枝，達到豐產穩產。
番石榴樹在盛果期要維護中庸樹勢，修剪加重，保持樹冠內膛枝條分佈均勻，培養健壯的結果母枝。
對於生長勢壯旺的，要加以控制，則在坐果節位之後摘心，使新梢自果實以下的葉腋萌發生長若樹勢生長勢欠旺，要增強樹勢，擴大樹冠，則在坐果節位之上留3~4節再摘心，使新梢在果實上部長出。
着果後，在果實上端3~4節摘心，一般整樹的結果枝保留三分之一或二分之一不摘心，使頂端再次萌發新梢，為再次開花着果做好準備，這樣能避免花期過於集中，對調節花期、產期，效果顯著。
新梢現蕾開花後，應對樹體進行開心水平式修剪，即把主枝誘引斜伸近水平狀，矮化樹體，開張樹冠，減少病蟲危害。
枝條修剪主要是將過密枝、細弱枝、老化枝剪除，保留髮育良好生長充實的結果母枝。修剪量控制在全樹冠的35%~60%，下次輪換修剪其餘枝條。
在夏季高温時，修剪時要根據樹勢及掛果情況，對結果枝進行摘心處理，對番石榴的頂芽、側芽和不定芽應適當抹除，以免枝梢過密及徒長枝發生對未結果的枝梢長到30cm時摘心，促使成為粗短的結果母枝。冬季修剪以剪除枯枝、病蟲害枝、弱枝、交叉枝、斷折枝等。
番石榴樹在8年以上的老樹需及時強剪更新，因為隨着結果部位升高、外移，樹勢衰退。
番石榴老樹一般在春季離地面50~80cm處截剪副主枝、主枝，迫使副主枝、主枝上潛伏芽發為新梢，選留和培養為新的骨幹枝，形成新樹冠，恢復樹勢，重新開花結果。
番石榴若修剪不當會造成樹冠形成慢，落果，果實日灼，品質下降和經濟壽命縮短等。
種植後第3～6年，番石榴產量達到高峯，每畝產量能達5000～6500千克，第7年以後產量、品質逐漸下降
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