因為蕭山在歷史上長期屬於紹興府,建國後才被劃入杭州。歷史上,吳越文化是以錢塘江為界,江北為吳文化,江南為越文化,而蕭山屬於越文化,杭州主城區屬於吳文化。因為文化因素的影響,蕭山與杭州主城區融合也較為緩慢。
但是歷史文化因素是其次,主要是杭州獨特的財政體系造成的。杭州主城區區級財政收入是由市級統籌管理的,而蕭山的財政收入是獨立管理,因為蕭山之前是縣級市蕭山市,所以撤市設區後,財政收入依然保持獨立。