財政局現有科室機構如下:辦公室、綜合規劃科、條法税政科、預算科、國庫科、行政政法科、教科文科、經濟建設科、農業科、社會保障科、國資辦(企業科)、鄉財科、金融科、外經科、會計科、非税科、監督科、信用擔保中心、採購辦、綜改辦、信息中心、投資評審中心、國庫集中收付核算中心綜合科、國庫集中收付核算中心統管科、工資統發中心。