1、嘴形區別:金剛鸚鵡魚呈一字嘴形普通鸚鵡魚一般呈T字形、月牙形等且不能完全閉合。
2、頭背區別:金剛鸚鵡魚頭頂有肉瘤隆起普通鸚鵡魚頭背交接部位凹陷下去。
3、體型區別:金剛鸚鵡魚體型較長且扁,體長在25釐米左右,背鰭和臀鰭較短,下巴較凸普通鸚鵡魚體型短而圓,體長在15-20釐米,頭短且高。