如何區分這兩者，要視不同情況而定：一是看其交易的目的和合同具體內容。如果目的是存儲貨物或其合同內有貨物貯存這項內容，則為倉儲業服務二是看倉庫實際運營管理方。如果倉庫實際運營管理方屬於受託方，那麼此項為倉儲業服務三是看哪方負有保管義務和安全責任。如果受託方負有保管義務、合同貨物貯存的安全責任是由受託方全權負責的，那麼此項交易也屬於倉儲業範圍。
倉儲業代開增值税專用發票的徵收率為3%，相比代開租賃發票要低2個百分點。以某代開倉儲服務增值税的企業為例，涉及的含税服務費用為231085元，如開具租賃發票，需繳納11554.25元的營業税，但如果開具倉儲業務發票，只需繳納6730.63元增值税，兩者相差4823.62元，且增值税發票受票方還可以將6730.63元作為進項税金進行抵扣(這裏暫且不考慮涉及的所得税問題)。
因此，少數不動產租賃企業和個人會故意模糊兩者概念，希望矇混過關：一是打着存儲貨物的旗號經營其他應税業務。二是委託方雖用其倉庫存儲貨物但實際運營管理方不屬於受託方，或貨物貯存的安全責任由委託方全權負責或負主要責任等。三是由於倉儲業一般納税人税率為6%，遠低於貨物銷售17%的基本税率，兼營倉儲服務的一般納税人企業有可能人為虛增倉儲服務的開票金額，同時縮小應税銷售開票金額。
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