保質期較短的牛奶多為巴氏消毒法消毒的“均質”牛奶，用這種方法消毒可以使牛奶中的營養成分獲得較為理想的保存，是目前世界上最先進的牛奶消毒方法之一。所謂的“均質”，是指牛奶加工中的新工藝，就是把牛奶中的脂肪球粉碎，使脂肪充分溶入到蛋白質中去，從而防止脂肪黏附和凝結，也更利於人體吸收。
保質期一般在48小時以內，它們的營養價值與鮮牛奶差異不大，B族維生素的損失僅為10%左右，但是一些生理活性物質可能會失活。
牛奶在工廠裏的殺菌消毒主要有兩種方法：巴氏滅菌法和超高温滅菌法。
前者的通常做法是將原奶加温到攝氏72-80度3-15分鐘，這樣就能儘可能的殺滅原奶中對人體有害的微生物並能最大限度的保存牛奶的口感和營養價值。
而後者則是使用特殊的設備，將原奶加温到攝氏135-140度，保持1-3秒，徹底消滅原奶中的一切微生物，不過由於温度越高，對牛奶的口感和蛋白質等營養成分的破壞就越大，因此超高温滅菌奶的口感和營養價值就比巴氏滅菌的牛奶差多了。
不過由於中國的原奶質量差，所以許多企業的巴氏滅菌法都採用85-90度，甚至更高，以殺滅原奶中的大量微生物羣落。
這兩年還出現了所謂的“超巴”滅菌的工藝，温度高達120度以上，已經和標準的超高温沒什麼區別了不過就這樣還不行，所以這兩年來超高温滅菌奶越來越多不是例外，因為這種方法由於外包裝的先進性常見的超高温滅菌奶（利樂包）只要生產過程不出問題，保質期內變質的倒是較少。
不過超高温滅菌也不是萬能的，為了殺菌，就需要採用更長的時間，4秒不行就10秒，或者15秒，總之殺到無菌為止！
將牛奶用高温加熱法（巴氏殺菌法）處理後，可殺死牛奶中的病原菌，如大腸桿菌、熒光細菌、枯草桿菌、丁酸菌等，巴氏殺菌法不會引起蛋白質的變化和破壞維生素
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