一個完整的醫院信息系統應該既包
括醫院管理信息系統，又包括臨牀醫療信息系統。
醫院信息系統所包含的內容紛繁複
雜，依其在一個醫院的實現先後，大體可以分為以下三個階段:
1、管理信息系統
管理信息系統一般包括:門、急診掛號子系統
門、急診病人管理及計價收費子系統
住院病人管理子系統
藥庫、藥房管理子系統
病案管理子系統
醫療統計子系統
人事、工資管理子系統
財務管理與醫院經濟核算子系統
醫院後勤物資供應子系統
固定資產、醫療設備管理子系統院長辦公綜合查詢與輔助決策支持系統
臨牀醫療信息系統
臨牀醫療信息系統可能包括的內容很多，甚至可能是專科、專病、專理的信息處理系統，下面給出一些常見殺統的例子:
住院病人醫囑處理子系統護理信息系統
門診醫生工作站系統
臨牀實驗室檢查報告子系統醫學影像診斷報告處理系統放射科信息管理系統手術室管理子系統
功能檢查科室信息管理子系統病理卡片管理及病理科信息系統
血庫管理子系統
營養與膳食計劃管理子系統
臨牀用藥諮詢與控制子系統
3、醫院信息系統的高級應用醫學圖象實時傳輸與查詢、歸檔系統
(PictureArchivingandCommunicat ionSystem，PACS)
病人牀邊信息系統
計算機化的病人病案系統(CPR)科研支持系統
教學支持系統
Internet醫學情報系統遠程診斷與教學
品位站
