公孔雀魚身體的色彩更豐富,顏色比母孔雀魚更加豔麗,母孔雀的主要任務是產崽,相對公孔雀魚來説,就沒有那樣豔麗的色彩了,從這點上很容易看出孔雀魚的公母。
公孔雀魚的腹部是純白色,而母孔雀魚則是透明的。孔雀魚公母的腹部顏色是不同的,母孔雀魚一看就能夠認出來,因為它是透明的腹部,能夠看到內部的情況。