1、種屬不同。
紅瓜魚:學名紅尾圓鰺,屬於鱸形目鯵科圓鯵屬。
黃花魚:屬於鱸形目石首魚科黃魚屬。
2、外形差異。
紅瓜魚:體型呈菱形,體色黑褐色,頭大,成年體長20-40釐米。
黃花魚:體型近乎長方形,成年體長20-30釐米,頭大側扁,吻鈍,體背灰黃色,兩側及下部金黃色。