北京檢查站是可以用電子身份證的,因為北京檢查站主要是為了檢查進京人員不能攜帶危險物品進京,不能帶管制刀具進京,嚴查網上通緝人員建立的,你要是沒帶身份證,手機上有電子身份證也是可以的,電子身份證不能走自助刷卡機,只能是你把電子身份證交給警察,讓警察在警務通上查找,然後才可以進京。所以説北京檢查站是可以用電子身份證的。