1、出資人不同:自然人獨資企業只能由自然人出資設立,法人獨資是一個具有法人資格的企業作為唯一出資股東設立的公司
2、責任承擔不同:在自然人企業中,非法人的自然人企業不能獨立承擔民事責任。必須由經營者來承擔無限連帶責任,法人獨資是指依照法律規定,由股東出資設立的以營利為目的的社團法人,公司一般能夠獨立承擔民事責任
3、適用法律:自然人獨資企業依照個人獨資企業法設立,個體工商户依照民法典(2021年1月1日起實施)、城鄉個體工商户管理暫行條例的規定設立,法人獨資企業依據公司法設立,並受其調整。