在魚缸內養一些清潔類的魚，例如清道夫、老鼠魚等
清道夫
清潔魚一般生活在魚缸底層，平常不會游到魚缸中上層，去打擾其它魚類的生存環境，由於在底層，它們通常會在魚缸底部覓食，沉到魚缸底部的食物殘渣和水中有機物，它們都能吃掉，另外在清道夫張嘴時，還會吞嚥下魚類的糞便。如果魚缸內的雜質足夠它吃個飽的話，它是不會傻傻的去吃魚類的便便的，所以飼養清潔魚，就應該讓它發揮效果，不要餵食過多。
2、可以用網將魚屎撈出
小魚網
如果家裏的魚缸並不是很大，需要清理魚屎的話，可以用漁網直接將魚屎撈出，不過這樣操作比較麻煩，而且用網的時候還容易傷到金魚但如果主人沒有更好的辦法來清理魚屎，這種最為原始的手動辦法也是很有效的。
3、利用虹吸的原理，將糞便從缸底抽出
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