吊腳樓的用料也講究頗多,木料以杉樹為主。究其原因也是基於古代習俗。吊腳樓建於山中,氣候濕潤,要求防腐性好。杉樹不易腐爛,經過100多年也只是變舊,不會朽壞。
雖建造用料以杉樹為主,但吊腳樓的建造中,必有一根柱為楓木。這是因為在苗族傳説中,楓木為萬物始祖。《苗族古歌》中也有記載:“要是媽媽房,要是媽媽屋,楓木作中柱,牛楓木作中樑。”可見,苗族人對楓木十分重視,也因此,苗族人在建房時均依此習俗為之。
建造者在附近的山坡上找優質杉木,當作中柱(吊腳樓中間的柱,稱為中柱)。中柱的選擇有講究,所選樹木高且直,上下均勻,不得有雷擊或馬蜂窩,樹枝也不可有斷裂。