這兩種瓜苗的區別是:絲瓜苗的莖杆和葉片呈青綠色，葉片比較光滑而薄，莖杆也較細而光滑而南瓜苗的葉片和莖杆都呈綠白色，葉片和莖杆上都有一層白色絨毛，莖杆較粗壯，葉片也厚實，用手摸有一種扎手的感覺所以二者的區別還是很大的。
絲瓜苗和南瓜苗的主要區別在葉子上，南瓜苗葉片寬卵形或卵圓形，有5角或5淺裂，中間裂片密被黃白色剛毛和茸毛，常有白斑葉柄粗壯，被短剛毛。絲瓜苗葉片三角形或近圓形，通常掌狀5-7裂，中間裂片上面深綠色，粗糙，有疣點葉柄粗糙，近無毛。
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