就是厭氧微生物在隔絕空氣不與分子態氧接觸的情況下進行的發酵過程。一般適用於微生物作用於有機化合物的分解代謝,反應時放出氣體同時產生熱量。
在隔絕氧氣的情況下進行的發酵過程,原理是因為有些細菌只能在無氧的情況下進行發酵,使一些物質轉化成人們生產和生活所需要的微生物能源、微生物飼料、微生物肥料等等。
可以用來作沼氣發酵的原料有很多,最常用的是人、畜(豬、牛、羊、雞、鴨、鵝等)糞便,各種作物秸稈(稻草、麥草、玉米秸)、青雜草、爛菜葉、水葫蘆、有機廢渣、廢水(酒糟、制豆腐的廢渣水、屠宰場廢水)等都是很好的發酵原料。