為了防止發熱黴變和蟲蛀，保持種子生活力、純度和淨度，種子要在冷藏庫貯藏，不同的種子對温度濕度也有不同。種子冷藏庫的組成：製冷設備製冷、蒸發器，保温板，微電腦温控系統及節流裝置等設備組成。
1、種子冷藏庫用於貯藏種子，可以更好的提高農業生產種子播種質量，是可靠的物質基礎。 種子冷藏庫可以用於貯藏雜交水稻、玉米種子等，根據觀察分析明確種子適宜冷藏庫貯藏的平均相對温度是11.2℃，平均相對濕度為63.8%。在種子冷藏庫貯藏兩年的種子檢測分析表現，種子的水分基本不變，冷藏庫貯藏的種子經濟效益也是非常明顯的。
2、短期種子冷藏庫 也就是根據冷藏庫設計的貯藏的條件，生產性種子可保存壽命預期在2~5年。短期種子冷藏庫設計冷庫温度控制在15℃～20℃，冷庫相對濕度控制在50%～60%種子貯藏時可用紙袋、布袋、塑料袋及玻璃容積包裝貯藏。
3、中期種子冷藏庫 用於貯藏流動性種子，其種子壽命預期時候在10～30年。種子冷藏庫相對温度設計控制在0℃～10℃，相對濕度不大於60%中期種子冷藏庫貯藏在如：金屬盒、玻璃容積、鋁箔袋、塑料複合膜袋等不透氣的容積內，保持種子含水量在6%～9%。
4、長期種子冷藏庫 用於長時間保存種子，可以保持種子壽命在30～50年，或者更長時間。根據國際長期保持種子參考温度為-18℃或是更低，種子含水量為5±1%所以長期種子冷藏冷庫設計的相對温度控制在-10℃～-20℃，相對温度不大於60%。用於長期貯藏的種子包裝和中期貯藏包裝是一樣的，一定要不透氣。
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