種族不同:蒲瓜是屬於南瓜族。冬瓜則是屬於冬瓜族的。這兩種完全是不一樣的種族。
形狀不同:蒲瓜的果實大多為圓筒狀或棒槌狀,瓜不僅有圓筒狀,還有短筒狀和束腰形狀還有扁圓狀。
根系區別:冬瓜根系發達,莖為蔓性,可以長達3~4米,分枝性強。蒲瓜全株密生軟毛,具卷鬚,能匍匐地面或攀附他物生長。