主要區別是種類的不同：第一，稻種是水稻或旱稻草本類稻屬植物的種子。第二，而麥種是麥子植物門單子葉植物的種子。
麥子，單子葉植物，禾本科。一年生或二年生草本植物。按播種期分冬小麥和春小麥。小麥屬於禾本科的小麥屬，是世界上最早栽培的農作物之一，經過長期的發展，已經成為世界上分佈最廣、面積最大、總產最高、貿易額最多、營養價值最高的糧食作物之一。
稻種和麥種都是人們的糧食，稻種是生長在水田中的，而且水稻的生長期一定要有水，否則稻會死掉，而麥種是種在早地上的，不能有積水
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