比南瓜籽大的瓜子叫西瓜籽。西瓜的種子扁平，寬卵形或矩形，具有喙和眼點，由種皮和胚組成。種皮堅硬，表皮平滑或有裂紋，種子的色澤變化很大，可分為白色、黃色、紅色、褐色、黑色等。不同品種種子的色澤及深淺均有差異。
種子的大小差異懸殊，大籽種子每粒重達100毫克以上，小籽種子只有10毫克左右。根據種子的大小可將西瓜分為大籽型和小籽型品種
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