1、選留小個球莖作種：選種、留種是荸薺生產眾多環節中的第一環，作種用的馬蹄球莖大小代表着貯藏營養物質的多寡，直接關係到馬蹄苗的粗壯與細弱。部分馬蹄種植户只考慮當年當季的效益，把大個球莖作商品出售，而留小個球莖作種，從而導致馬蹄苗難以達到壯苗標準，給後續的生產管理增加了難度。
2、栽培季節偏遲：馬蹄地下結球數量與質量主要取決於地上部葉狀莖的光合能力。適宜的葉狀莖羣體結構，可製造更多的光合產物供地下部結出球莖，較易獲得高產優質的馬蹄。荔浦縣很多馬蹄在水稻收穫後種植，而部分馬蹄種植户想要早稻高產些，種植成熟期較長的水稻品種，使馬蹄栽植時間偏遲，葉狀莖不能按時形成合理的羣體結構，從而影響其光合能力和光合產物的形成，導致馬蹄球莖營養積累時間不足，地下部結出球莖數量少，個頭小。
3、施肥不合理：生產上存在重化肥、輕有機肥的現象，有機肥用量日趨減少，化肥用量逐年增大，氮磷鉀比例失調，微量元素也嚴重缺乏。明顯表現在氮肥施入量偏大，致使馬蹄葉狀莖偏細偏嫩，植株抗逆性差，病蟲害發生嚴重，導致產量下降，品質較差。
4、盲目用藥：部分馬蹄種植户不重視田間病蟲害的預測預報，沒有根據馬蹄病蟲害發生種類對症用藥，跟着其他農户盲目用藥有的馬蹄種植户不根據害蟲發生特點及發育階段選用農藥，而是隨意選擇藥劑種類有的馬蹄種植户見蟲就打藥，濫用農藥。選藥和施藥時機掌握不準確，導致病蟲害防治效果差、成本高，造成馬蹄產量和品質下降。
5、施藥技術不成熟：馬蹄種植户配藥時沒有計量工具，普遍使用瓶蓋計量，存在隨意加大農藥使用濃度的傾向配藥時不攪拌或攪拌不充分，造成局部濃度過高部分馬蹄種植户噴藥時採用大孔徑噴頭噴霧，致使霧滴過大，農藥不容易附着且藥液在空氣中滯留時間過短，大大降低了用藥效果部分馬蹄種植户在早晨露水未乾時噴藥，從而降低了藥液有效濃度部分馬蹄種植户在晴天中午噴藥，藥液迅速揮發。不成熟的施藥技術不但沒有起到較好的病蟲害防治作用，反而導致環境受到污染，生產成本大大提高。
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